El proyecto editorial del PUIC desarrolla los procesos editoriales de publicaciones impresas y electrónicas. Los textos que se publican son para lectores especializados pero también para cuadros en formación académica y para el público en general. La Pluralidad Cultural en México, Informes y Estudios, Estado del Desarrollo Económico y Social de los Pueblos Indígenas, Tecnologías Tradicionales Utilitarias de México, Las antiguas raíces, constituyen las 5 colecciones editoriales del PUIC.