El Instituto presenta una colección de Atlas de México y de diversos lugares, como una oportunidad para dar conocer colecciones de mapas, territorios determinados y cartografía. Entre los mapas se encuentran, el Atlas regional del istmo de Tehuantepec, Nuevo atlas de migración interna en México, Atlas de la laguna del lago de Cuitzeo: Análisis de su geografía y su entorno socioambiental, entre otros más.